O Ágar EMB, originalmente recomendado por Levine, é usado para isolar e identificar Escherichia coli e Enterobacter, assim como bactérias intestinais Gram-negativas presentes em produtos farmacêuticos, laticínios e outros produtos alimentícios. Ele é também utilizado como um meio de isolamento e identificação em testes de qualidade da água, após cultura em meio líquido (testes presuntivos)